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Novel technology expected to greatly advance the burgeoning field of dynamic genomics

Wide range of possible translational and clinical applications, including virology and epigenetic biomarker discovery for liquid biopsy tests

 

Paris, France and Cambridge, UK – 18th March 2021 – Depixus®, a biotechnology company developing a unique platform technology for the fast, accurate, and inexpensive extraction of multiomic information from DNA, RNA, and protein, today announces the publication of a scientific paper in the peer-reviewed journal Communications Biology, part of Nature Research journals. The paper, entitled ‘Detection of genetic variation and base modifications at base-pair resolution on both DNA and RNA’, can be freely downloaded from here.

 

Dr. Gordon Hamilton, co-founder and Chief Executive Officer of Depixus, said: “Our novel technology, known as MAGNA™, can decode many new layers of dynamic genetic information held within DNA, RNA, and proteins. These information layers – that can be collectively described as the ‘dynamic genome’ – include the multitude of base modifications that pattern both DNA and RNA, as well as the many ways in which these nucleic acids can be constructed, folded, and packaged within cells. In this paper, we are excited to be publishing data that demonstrates how our MAGNA™ platform can sequence a wide range of base modifications on long molecules of both DNA and RNA with very high accuracy and without need for sample amplification. We also provide an example of how the technology, when applied to analysis of genetic disease from DNA coming from a female carrier of Fragile X Syndrome, can reveal the extent of the genetic and epigenetic perturbations that are associated with disease severity.

 

“Progress in decoding the dynamic genome is currently hampered by the lack of robust tools. The MAGNA™ platform was purpose-designed to resolve this problem and is being developed to allow researchers to open up new areas of genetic science, in particular in the burgeoning fields of epigenomics and epitranscriptomics. The data provided by MAGNA™ will help in better understanding the genomics of biological systems and will provide new insights into the pathogenesis of disease. The current coronavirus pandemic has highlighted the need for a much deeper understanding of the role that RNA base modifications play in virus-host interactions. The analysis of base modification patterning on DNA is already transforming the field of liquid-biopsy for early cancer detection.”

 

Epigenetics refers to a “heritable” phenomenon in which phenotype changes are driven by processes that are independent of DNA sequence. DNA base modifications play central roles in such epigenetic processes. Epitranscriptomics, a new but fast-growing field, is the study of the enormous number of chemical modifications to RNA, and the proteins that write, erase, and read these modifications. In recent years, reversible modifications on nucleic acids (DNA and RNA) have been shown to play essential roles in many biological processes in health and disease.

 

Depixus is developing its MAGNA™ technology for future commercial launch. The company is based in Paris, France and Cambridge, UK, and over 2021 will be actively recruiting top talent to join its team.

 

For further information, please contact:

Depixus®

Gordon Hamilton, President/CEO

gordon.hamilton@depixus.com

 

Optimum Strategic Communications

Supriya Mathur, Shabnam Bashir

depixus@optimumcomms.com

+44 (0) 203 922 0891

 

About Depixus® and MAGNA™

Depixus® is a fast-growing innovative biotechnology company based in Paris, France, and Cambridge, UK, developing its cutting-edge MAGNA™ technology to reveal the secrets of the dynamic genome. The technology is set to transform our understanding of how genetics is regulated and provide powerful new insights into the mechanisms of disease.

 

The MAGNA™ technology is based on an instrument system called a ‘magnetic trap’. Samples of nucleic acid are captured within a flow cell and then can be analyzed at multiple levels of resolution. The following animation – available on Vimeo – introduces the way the MAGNA™ technology works and some of the many different assays that can be performed with the platform.

 

For further information, please visit www.depixus.com.

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Version française

Depixus® annonce la publication de la détection de variations de séquence et de modifications des bases sur l’ADN et l’ARN en utilisant sa nouvelle technologie MAGNATM dans une revue à comité de lecture.

Une technologie nouvelle qui devrait considérablement accompagner l’éclosion de la génomique dynamique.

Large éventail d’applications translationnelles et cliniques possibles, dont la virologie et la découverte de biomarqueurs épigénétiques pour les tests de biopsie liquide.

 

Paris, France et Cambridge, Royaume-Uni – 18 mars 2021 – Depixus®, société de biotechnologie développant une plateforme technologique unique pour l’extraction rapide, précise et peu coûteuse d’informations multiomiques de l’ADN, de l’ARN et des protéines, annonce aujourd’hui la publication d’un article scientifique dans la revue à comité de lecture Communications Biology, qui fait partie des revues Nature Research. L’article, intitulé « Detection of genetic variation and base modications at base-pair resolution on both DNA and RNA », peut être téléchargé gratuitement ici.

 

Dr Gordon Hamilton, cofondateur, président et CEO de Depixus, a déclaré : « Notre nouvelle technologie, MAGNA™, peut décoder de nombreuses nouvelles couches d’informations génétiques dynamiques contenues dans l’ADN, l’ARN et les protéines. Ces couches d’informations – regroupées dans le concept de génome dynamique – comprennent la multitude de modifications des bases qui composent l’ADN et l’ARN, ainsi que les nombreuses façons dont ces acides nucléiques peuvent être construits, pliés et empaquetés dans les cellules. Dans cet article, nous sommes heureux de démontrer la capacité de MAGNATM de séquencer un large éventail de modifications de bases sur de longues molécules d’ADN et d’ARN, avec une très grande précision et sans recours à l’amplification préalable des échantillons. Nous démontrons également un exemple d’application de la technologie à l’étude d’une maladie génétique, au travers de l’analyse des perturbations génétiques et épigénétiques associées à la gravité de la maladie, d’un échantillon ADN provenant d’une femme porteuse du syndrome du X fragile.

 

L’étude du génome dynamique est actuellement freinée par le manque d’outils robustes. La plateforme MAGNA™, conçue spécifiquement pour résoudre ce problème, est développée pour fournir aux chercheurs le moyen d’explorer de nouveaux domaines de la science génétique, en particulier dans les domaines récents et en plein essor de l’épigénomique et de l’épitranscriptomique. Les données fournies par MAGNA™ aideront à mieux comprendre la génomique des systèmes biologiques et apporteront de nouvelles connaissances sur la pathogenèse des maladies : par exemple, la pandémie actuelle de coronavirus a mis en évidence la nécessité d’une compréhension beaucoup plus approfondie du rôle que les modifications des bases de l’ARN jouent dans les interactions virus-hôte. Parallèlement, l’analyse des modifications de bases sur l’ADN est déjà en train de transformer le domaine de la biopsie liquide pour la détection précoce du cancer ».

 

L’épigénétique désigne un phénomène « héréditaire » dans lequel les modifications du phénotype sont déterminées par des processus indépendants de la séquence d’ADN. Les modifications des bases de l’ADN jouent un rôle central dans ces processus épigénétiques. L’épitranscriptomique, un domaine nouveau et en pleine expansion, désigne l’étude du nombre considérable de modifications chimiques de l’ARN et des protéines qui écrivent, effacent et lisent ces modifications. Ces dernières années, il a été démontré que des modifications réversibles sur les acides nucléiques (ADN et ARN) jouent un rôle essentiel dans de nombreux processus biologiques dans la santé et la maladie.

 

Depixus développe sa technologie MAGNA™ en vue d’un futur lancement commercial. L’entreprise est basée à Paris, en France, et à Cambridge, au Royaume-Uni, et, au cours de l’année 2021, recrutera activement les meilleurs talents pour rejoindre son équipe.

 

Pour de plus amples informations, veuillez contacter :

Depixus

Gordon Hamilton, Président/CEO

gordon.hamilton@depixus.com

 

Optimum Strategic Communications

Supriya Mathur, Shabnam Bashir

depixus@optimumcomms.com

+44 (0) 203 922 0891

 

À propos de Depixus® et MAGNA™

Depixus® est une société de biotechnologie innovante à croissance rapide basée à Paris, en France, et à Cambridge, au Royaume-Uni, qui développe sa technologie de pointe MAGNA™ pour révéler les secrets du génome dynamique. Cette technologie est appelée à transformer notre compréhension de la régulation de la génétique et à révéler des informations nouvelles et centrales sur les mécanismes des maladies.

 

La technologie MAGNA™ est basée sur un système d’instrumentation appelé « piège magnétique ». Les échantillons d’acide nucléique sont capturés dans une cellule à écoulement et peuvent ensuite être analysés à plusieurs niveaux de résolution. L’animation suivante – disponible sur Vimeo – présente le fonctionnement de la technologie MAGNA™ et quelques-uns des nombreux essais différents qui peuvent être réalisés avec la plateforme.

 

Pour de plus amples informations, veuillez consulter le site www.depixus.com.